晋朝以后，道教、等宗教在中国兴盛起来了。宗教利用了气功，把气功神秘化了。本来气功是练气修德，很具体很实际的，可是宗教化以后，就追求修炼成神、成仙、成佛了。这么一来，气功的科学本质没有了。但如果翻开中国气功史，可看到就在晋、隋、唐这一时期，有很多古人用气来命名的著作，如《气诀》、《气经》等，书中写的都是练气、用气的内容。《气经》中讲了几十种练气、用气的方法，连发放外气的方法都有，叫“布气”。以后的宗教淹没了气功，气功的名词就没了。
宋朝的气功
金、元之后，很多练功夫的，为了抵外族的侵略，将气功的修炼用到武术上来，逐渐形成了武术气功。随着武术气功的兴起，慢慢破除了宗教的神学思想。你说有神、有佛、有鬼，练功时求神、拜佛，说有神、佛保佑，可是打仗的时候有本事的打死没本事的，这个时候神、佛怎么不来保佑?慢慢人们对宗教的信仰就淡漠了，气功又逐渐从宗教里面分离出来，重新开始讲气练气，宋代就讲吐纳之气了。随着武术气功的发展，武当派、少林派两大家逐渐形成。
明清的气功
清末有了武当派的著作，也有了少林派的著作《少林拳术秘诀》，内有专章叫《气功阐微》，专门阐述气功。其中明确指出：“气功之说有二：一养气、一练气。”于是气功一词又逐渐叫起来了，明清以后讲练气比较突出，到民国初年搞气功的人就多了。1931年王竹林正式出版了《意气功详解》一书，直接以气功命名。很多医生通过学练道家、佛家功夫，把它用到医疗上来，称之为“气功疗法”。最早是1934年董浩写的《肺痨病特殊疗法——气功疗法》，1938年方公溥又出版了《气功治验录》，还创立了“公溥气功治疗院”。
近代的气功
这样，气功一词，起于晋代许逊《灵剑子》一书中的“道气功成”，以后发展到武术气功，又以后成了气功疗法，但气功一词却没有广泛传开。一直到了解放以后，有个老干部叫刘贵珍，在河北省卫生厅的同意和支持下，将自己练功与多年临床经验予以总结，定了一本《气功疗法实践》，该书在卫生部的关怀下，正式出版，以后还译成外文，“气功疗法”在国内外就传开了。以后又把气功作为中医学的一部分，成立了气功疗养院、气功疗养所，在气功治疗、气功研究方面均取得了很大成绩。遗憾的是特殊时期把中国的传统文化——气功打入十八层地狱的最底层。搞气功的都成了“牛鬼蛇神”。
这样一来把气功基本“杀”的差不多了，扫干净了。“特殊时期”结束之后气功事业发生了空前的变化，正道功派发展成为一门独特的科学。大家都约定俗成了，一说气功都懂得指的是一门特殊的学问，“气功”成了关于人们身心健康的一门特殊学问的代名词了。
6分类区别
分类
一般而言，气功可分两种，即养气与炼气。养气就是道家静坐功夫，把气运在丹田，使之凝聚不散，不让身外景物诱导而外泄。炼气乃以运行为主。如拳术家在练拳时要用臂力，就把气运到臂上；用腰力，就把气运到腰上；假如四肢百胲都用力时，就把气运到全身。气有呼吸的区别，呼为阳，吸为阴；呼为动，吸为静；呼为刚，吸为柔。要把阴阳、刚柔、动静结合在一起，才能完成它的作用。气要运行时，不可逆走，贵当顺行。如顺行的话，不但脏腑会舒畅，并可快慢自如；倘若逆运的话，内部各脏腑就要受到伤害，一些习练者练岔气致伤致残者时有所见。
7特点
简介
第一、经络、穴位、气血学说是中国气功的理论基础。中国传统医学包括丰富的内容，气功是中国传统医学宝库的一颗瑰丽的明珠。经络、穴位、气血学说，是中国传统医学的理论，是中国气功的理论基础。经络、穴位、气血是非常复杂的人体现象。可以简单而形象地解释：经络是气血运行的通道，穴位是气血运行的出入口。
气功健身祛病的道理在于穴位受到良性刺激，气血在经络中运行通畅。
天人合一
中国气功体现了天人合一，人和自然合一、形神合一的整体观。
中国气功强调天人合一，人和自然界有着密切不可分割的联系，人的机体受到气候、环境等因素的影响。中国气功重视人与自然界的动态适应。
中国气功强调人与社会的统一。社会环境对人的健康和疾病有着密切的关系，中国气功修练强调人要适应社会。
中国气功强调形神统一。气功是一种中国特色的自我身心锻炼方法。它既可以提高人体的生理功能，又能提高人体的心理功能。气功提高人体生理功能与心理功能是同时进行的，二者相互联系、相互制约。
历史流派
气功在历史上处于汉族民间流传的状态，并形成了医家、儒家、道家、武家等众多的流派。医家气功强调保健、延年，道家气功讲求性命双修。
叩首法
叩首，顾名思义就是磕头，有人问，磕头也是锻炼吗？那当然，磕头还是道家修身秘法之一呢！
“学道本无门，叩首先有益”。但是，咱们练的叩首不是头碰地，而是头叩手背，就像是我们趴在桌上打盹时将额头压在手背上的感觉。也就是说，怕我们的额头直接磕在地板上会疼痛受伤，就用手垫着。这样额头撞在手背上，既不会因接触面太软而无效，也不会觉太硬而受伤。
然后按拜佛叩头的样子，以额头部分（鼻根至前发际线）撞击手背，幅度和力度因人而异，本着由轻而重的原则。抬头再叩时要有一个头后仰的动作，每15次为一小节。接着从鼻根到下巴轻轻“撞揉”手背，每反复10次为一小节，“撞揉”时面部始终与手背相贴进行（“撞揉”时频率要快，如震颤一般），两节为一组。
如此可使任督二脉在头部顺接，为打通小周天的第一步（高血压患者暂不可练此功）。