拿下伊犁城之后，项南分兵两处，分别去收服南疆、北疆。
他则坐镇伊犁，负责伊犁之后的治理。
毕竟攻下伊犁城一回事，治理它是另一回事。
如果只打不治，那么等清军一撤，西域很容易就会反叛的。
以往朝廷跟准葛尔汗国打，就是打了之后没管理好，结果才让准葛尔死灰复燃。
项南自然不会犯那种错误，他随即颁布旨意，在伊犁城设立伊犁将军府，在此驻军，管理西域。
并下令从内地迁移民入疆，为此特地命户部拨银百万两，在西域建立屯田所，帮助内地移民在西域落脚。只要肯来的都分田地、房屋、牲口等。
项南还准备在伊犁河两岸修筑八座城池，来拱卫伊犁。不仅能够扼住贸易的咽喉要道，而且一方有难，八方支援，也能更好地拱卫伊犁。
……
六个月后，清军已横扫南疆、北疆，准葛尔汗国彻底被灭。
而准葛尔汗国被灭之后，西域各大小部族纷纷请降，表示愿意归顺大清。
他们都没想到，准葛尔汗国会败得如此之快。
清军入疆不到一个月时间，已经攻陷镇远、高昌、迪化、伊犁，打垮准葛尔十五万大军，生擒阿占汗等一众贵族大臣，半年之内便已平定南疆、北疆。
这样的战力，实在让他们惶恐不已。
连准葛尔汗国都如此脆弱，他们这些小部族哪里还会是对手，自然纷纷请降，希望能够归顺大清，免遭战火。
项南也不计较他们朝秦暮楚，三心两意的行为。毕竟对于小部族来说，在夹缝中挣扎求存，左右讨好也是难免的事情。
把他们全殺了的话，未免太残忍，也不利于边境的团结稳定。倒不如赦免他们的过往，接受他们的请降，只要他们以后乖乖听话也就是了。
另外，项南还特别恩典，他们的儿子可以送来伊犁将军府学习四书五经，中原文化，将来还可以参加科举、授予官职等等。
当然，这名义上是恩典，其实就让他们的儿子做质子，敢有异动就直接殺他们的儿子。而且中原文化相较西域文化，毕竟更加丰富多彩。
如果他们肯接受中原文化的洗礼，那么势必会增加对中原的认同，这也会避免罗刹国等外部势力的渗透。
总而言之，这对清朝是一件好事。
各部的酋长自然也知道项南的真实意图。只不过现在清军横扫南疆北疆，连准葛尔十万大军都不是敌手。
他们这些小部族，多则不过十来万，少则不过几万人，哪里是清军的敌手，因此只得乖乖从命，还要叩谢项南的恩典。
此时，围绕伊犁城的八座城池也已经拔地而起，如拱卫之势守护伊犁城。从内地迁来的数十万移民已经入住移民屯，未来还会有百万移民进入西域。
而项南也已从京城调来官员，正式接管伊犁将军府，将南疆、北疆置于清廷治下。
如此一来，征讨之事已毕，项南随即准备班师回朝。
临行之前，他嘱咐接掌伊犁将军府的大臣赫尔勒，“你除了防范准葛尔部、寒部等之外，最要紧防范罗刹国的侵袭。只要它敢袭扰我边境，一律迎头痛击。